A lo largo de su experiencia la CAJ ha contribuido a los procesos de reforma judicial en algunos países de la Región Andina y cada año en su Informe Anual dedica una sección a la situación de los Sistemas de Justicia en la Región Andina .
En los últimos años, la CAJ ha desarrollado investigaciones en materia de corrupción judicial. Uno de estos trabajos ha sido la publicación "Corrupción Judicial, Mecanismos de Control y Vigilancia Ciudadana", a partir del cual se desarrollan proyectos que permiten prevenir la corrupción, pero especialmente darle un contenido social al principio de independencia judicial desde de la participación ciudadana.
Asimismo, se desarrollan permanentemente investigaciones que permiten incursionar en el campo de la protección del medio ambiente, la descentralización y la gestión de gobierno entre otros.
Por otro lado, el área colabora con la elaboración de iniciativas legislativas en las que se desarrollan procesos de consulta abiertos y plurales para la elaboración de proyectos.